Vas Gradenje, z nadmorsko višino 221 metrov, je razložena po jugozahodnem vznožju vinogradniškega Vinjega vrha, ki se dviga nad levim bregom Krke in avtocesto Ljubljana–Zagreb. V zaledju Gradenja in nekdanjega zaselka Mlada Vina sta veliki gomilni nekropoli iz starejše železne dobe, ki pripadata naselbini na Vinjem Vrhu.